肛门指检时，患者一般采取侧卧位、膝胸位等，医生戴上手套或指套，涂抹润滑剂后，将手指缓缓插入肛门进行检查。
检查前准备
检查前应排空大便，放松身体，配合医生。对于儿童，要安抚其情绪，使其尽量放松，以利于检查顺利进行。
检查时感受
检查时可能会有轻微的胀满感，一般不会有剧烈疼痛，若患者过于紧张可能会加重不适感。老年人或体质较弱者检查时需轻柔操作，避免造成不适。
检查能发现的问题
可发现痔疮、肛瘘、直肠息肉、直肠癌等疾病。比如能触及直肠内的肿块、了解肛管括约肌的紧张度等情况。对于有便血、排便习惯改变等症状的患者，肛门指检是初步筛查肛肠疾病的重要方法。
特殊人群注意事项
孕妇进行肛门指检时要谨慎，动作需轻柔，避免过度刺激引起不适。有肛周急性炎症的患者检查时要特别小心，防止炎症扩散，检查后要注意局部清洁。