肛门指检主要用于检查肛管直肠部位的多种问题。
检查肛管直肠的病变
可发现肛管直肠是否有肿物，比如直肠癌等肿瘤性病变，能触摸到肿块的大小、质地、活动度等情况；还能察觉肛管直肠有无炎症、狭窄等问题。
检查前列腺（男性）
对于男性，肛门指检可以触摸前列腺的大小、质地、有无结节等，有助于初步判断前列腺是否存在增生、炎症等状况。
检查女性盆腔情况
女性进行肛门指检时，能对盆腔内的一些器官，如子宫、附件等进行初步的触诊了解，辅助判断是否有相关病变。
检查肠道内的异物
若肠道内有异物，肛门指检有可能触及异物的位置等情况。
特殊人群方面，老年人由于身体机能变化，肛门指检更需轻柔操作；儿童进行肛门指检时要特别谨慎，由专业医护人员规范进行，以避免给儿童造成不适和损伤。