萎缩性胃炎部分患者可以治好，其预后与多种因素相关，经过规范治疗及合理调养有治愈可能，但也有部分患者病情会有变化。
一、幽门螺杆菌感染相关情况
若萎缩性胃炎是由幽门螺杆菌感染引起，在规范进行幽门螺杆菌根除治疗后，部分患者胃黏膜萎缩情况可得到改善甚至治愈。因为幽门螺杆菌被清除后，胃黏膜炎症环境得到改善，利于修复。
二、非幽门螺杆菌感染相关情况
对于非幽门螺杆菌感染因素导致的萎缩性胃炎，如自身免疫因素等，通过积极治疗基础疾病、改善生活方式等，也有病情稳定、症状缓解甚至胃黏膜萎缩情况好转的可能，但相对幽门螺杆菌感染相关的可能治疗进程会更复杂些。
三、患者自身因素影响
患者自身的生活方式对萎缩性胃炎的转归很重要。比如规律作息、健康饮食（避免辛辣刺激、腌制食物等）、戒烟限酒的患者，更有利于病情的控制及好转；而长期熬夜、饮食不规律、持续不良情绪等情况存在时，会影响治疗效果，增加病情反复或进展的风险。
四、定期监测很关键
无论哪种原因引起的萎缩性胃炎，都需要定期进行胃镜等检查监测病情变化。一旦发现异常情况能及时处理，对于把握治疗时机、更好地判断是否能达到较好的治疗效果很有帮助。比如定期胃镜检查可观察胃黏膜萎缩情况有无改善、有无出现不典型增生等病变情况。