怀孕35-55天进行流产手术对身体伤害最小。此时孕囊大小适中，手术难度和风险较低，对子宫的损伤也最小，术后恢复较快。但具体的手术时间还需根据孕囊的发育情况和个人身体状况来决定，建议在医生的指导下进行选择。
此外，流产手术对身体有一定的伤害，可能会引发以下并发症：
出血：手术过程中可能会损伤子宫壁，导致出血。如果出血量较大，需要及时就医处理。
感染：手术过程中如果消毒不严格，或术后护理不当，可能会引发感染。表现为发热、腹痛、分泌物异味等。
子宫穿孔：手术过程中可能会出现子宫穿孔的情况，如果穿孔较小，没有明显症状，可保守治疗；如果穿孔较大，需要手术治疗。
其他：如月经失调、习惯性流产、不孕等。
为了将流产对身体的伤害降到最低，建议在术前做好充分的准备，包括完善相关检查、选择正规的医疗机构、手术前后注意护理等。术后也需要注意休息，加强营养，保持外阴清洁，避免过早同房和盆浴。如果出现异常情况，如出血过多、发热、腹痛等，应及时就医。