输卵管双侧间质部堵塞的最佳治疗方法需要根据具体情况来选择，常见的治疗方法有以下几种：
1.输卵管通液术：通过向宫腔内注入生理盐水，利用水压的力量将堵塞的输卵管疏通。这种方法简单、无创，但成功率相对较低。
2.宫腔镜下输卵管插管通液术：在宫腔镜的引导下，将输卵管插管插入输卵管，进行通液治疗。这种方法可以直接观察输卵管的情况，并进行针对性的治疗，成功率较高。
3.腹腔镜下输卵管造口术：通过腹腔镜手术，在输卵管间质部进行造口，解除堵塞。这种方法适用于间质部堵塞较为严重的情况，但手术创伤较大，需要全身麻醉。
4.试管婴儿：如果输卵管堵塞严重，无法通过上述方法治疗，或者患者年龄较大、卵巢功能减退，试管婴儿可能是最佳选择。试管婴儿是将卵子和精子在体外受精，培养成胚胎后再移植到子宫内，成功率较高。
除了上述治疗方法外，患者还可以在医生的指导下进行一些辅助治疗，如中药治疗、物理治疗等。此外，患者在治疗期间需要注意个人卫生，保持心情愉悦，避免过度劳累和紧张。
需要注意的是，输卵管堵塞的治疗方法需要根据患者的具体情况进行选择，建议患者在医生的指导下进行治疗。同时，患者在治疗期间需要注意定期复查，了解治疗效果，以便及时调整治疗方案。