精子畸形率99%会在一定程度上影响怀孕，具体分析如下：
1.受孕概率较低：精子畸形率是指精子形态异常的比例。正常情况下，精子需要具备正常的形态才能使卵子受精并发育成健康的胚胎。如果精子畸形率过高，可能会降低受孕的机会。
2.受孕风险增加：即使成功受孕，精子畸形率高也可能增加胚胎发育异常或早期流产的风险。畸形的精子可能无法正常受精或在受精后导致胚胎结构或功能的异常。
3.潜在健康问题：精子畸形率高可能暗示存在潜在的生殖系统问题或其他健康隐患。这可能与遗传因素、环境因素、生活方式等有关。
4.进一步检查和评估：对于精子畸形率高的情况，建议及时咨询专业的生殖医学专家或男科医生。他们可以进行详细的评估，包括精液分析、激素检查、遗传学检测等，以确定具体原因和潜在的风险。
5.治疗选择：根据具体情况，医生可能会建议采取一些治疗措施来改善精子质量。这可能包括调整生活方式（如戒烟、限酒、健康饮食、减少压力）、药物治疗（如抗氧化剂、维生素等）或其他针对特定病因的治疗方法。
6.辅助生殖技术：在某些情况下，如果自然受孕困难，医生可能会建议考虑辅助生殖技术，如体外受精（IVF）或卵胞浆内单精子注射（ICSI），以提高受孕机会。
需要注意的是，每个个体的情况都是独特的，治疗方案应根据具体情况制定。在面对精子畸形率问题时，及时咨询专业医生是非常重要的，他们可以提供个性化的建议和指导。此外，保持良好的生活习惯、减轻压力、遵循医生的治疗建议也是提高受孕机会和生育健康宝宝的重要因素。