精子畸形率达到99%时，怀孕的几率会受到很大影响，但具体的怀孕几率因人而异。
一般来说，正常男性的精子畸形率应该低于96%，如果畸形率达到99%，则意味着精子的形态异常非常严重，可能会影响精子的受精能力和胚胎的质量。
以下是一些可能的影响：
1.受精困难：精子畸形率高会增加受精的难度。正常形态的精子更容易穿透卵子的保护层并与卵子结合，而畸形精子可能无法正常受精。
2.胚胎质量：即使受精成功，畸形精子也可能影响胚胎的质量。异常的精子可能导致胚胎发育异常，增加流产、早产或出生缺陷的风险。
3.受孕机会：尽管存在受精的可能性，但由于精子畸形率高，受孕的机会仍然可能降低。
需要注意的是，精子畸形率只是评估男性生育能力的一个指标，还需要综合考虑其他因素，如精子的活力、数量和精液质量等。此外，女性的生育能力和受孕情况也会对怀孕几率产生影响。
对于想要怀孕的夫妇来说，建议及时就医，进行全面的生育能力评估。医生可能会建议采取以下措施：
1.进一步检查：进行其他相关检查，以确定是否存在其他潜在的问题，如精索静脉曲张、附睾炎等。
2.生活方式调整：保持健康的生活方式，如均衡饮食、适量运动、减少吸烟和饮酒等，有助于改善精子质量。
3.治疗潜在疾病：如果存在其他疾病，如前列腺炎、附睾炎等，需要进行相应的治疗。
4.辅助生殖技术：在某些情况下，夫妇可能需要考虑辅助生殖技术，如体外受精（IVF）或卵胞浆内单精子注射（ICSI），以提高受孕机会。
每个夫妇的情况都是独特的，治疗方案应根据个体情况制定。如果对精子畸形率和怀孕几率有具体的担忧，最好咨询专业的生殖医生或男科医生，他们可以提供更详细和个性化的建议。此外，早期咨询和治疗可以增加成功受孕的机会，并提高生育健康宝宝的可能性。