卵黄囊是胚胎发生体褶后，原肠则明显地分成胚内的原肠和胚外的卵黄囊，内包有大量的卵黄，卵黄囊的壁由胚外内胚层和胚外中胚层形成。第二次做B超时卵黄囊不见了，可能是以下原因引起的：
1.超声技术限制：卵黄囊非常小，在超声检查时可能会因为位置、角度或其他因素而被遗漏。不同的超声医生或检查设备可能会对卵黄囊的检测产生影响。
2.孕周：卵黄囊通常在怀孕早期出现，随着孕周的增加，它会逐渐消失或被其他结构所取代。如果第二次B超的时间过早或过晚，可能会导致卵黄囊无法被检测到。
3.胚胎发育异常：如果胚胎存在发育问题，如胎停育或其他异常，卵黄囊可能会消失或出现异常。
4.其他因素：一些其他因素，如子宫肌瘤、子宫畸形或其他妇科问题，也可能影响卵黄囊的检测。
卵黄囊的消失并不一定意味着有严重的问题，但需要进一步的评估和监测。医生可能会建议进行以下检查或采取以下措施：
1.复查：医生可能会建议在一段时间后进行另一次B超检查，以确保胚胎的发育情况。
2.血液检查：医生可能会进行血液检查，如孕激素水平、HCG水平等，以评估胚胎的健康状况。
3.进一步检查：如果存在其他异常或担忧，医生可能会建议进行其他检查，如唐氏筛查、无创产前基因检测或宫腔镜检查等。
4.密切观察：医生会密切观察孕妇的身体状况和胎儿的发育情况，定期进行B超检查和其他必要的检查。
需要注意的是，每个孕妇的情况都是独特的，医生会根据具体情况制定个性化的诊断和治疗方案。如果对第二次B超时卵黄囊的消失感到担忧，应及时与医生沟通，了解更多信息并遵循医生的建议。医生会根据具体情况提供准确的诊断和适当的建议，以确保孕妇和胎儿的健康。