引起新生儿肌张力低的原因较多，通常分为以下几类：
1.先天因素：胎儿在母亲子宫内时，若存在宫内窘迫、发育畸形等情况，可能导致新生儿出生后肌张力低。
2.遗传因素：某些遗传疾病，如脊髓性肌萎缩症、先天性肌营养不良等，也可能引起新生儿肌张力低。
3.分娩因素：难产、早产、窒息等分娩过程中的问题，可能导致新生儿缺氧、缺血，从而引起脑部受损，出现肌张力低的情况。
4.疾病因素：新生儿若患有严重的黄疸、脑炎、脑膜炎等疾病，也可能影响脑部神经发育，导致肌张力低。
5.其他因素：母亲在怀孕期间营养不良、接触有害物质等，也可能对胎儿的发育产生影响，导致新生儿肌张力低。
关于新生儿肌张力低是否能够自愈，需要根据具体情况进行判断。一般来说，如果是轻微的肌张力低，且病因能够及时去除，如通过早期干预、康复训练等，部分患儿的肌张力可能逐渐恢复正常。但如果是严重的肌张力低，或存在先天性疾病、脑部损伤等情况，肌张力低可能难以自愈，需要长期进行康复治疗和训练，以帮助患儿改善症状。
需要注意的是，新生儿肌张力低可能是多种疾病的表现之一，家长一旦发现孩子有异常，应及时带其就医，进行全面的检查和评估，明确病因，并在医生的指导下进行针对性的治疗和康复训练。同时，家长也应积极配合医生，关注孩子的发育情况，给予孩子足够的关爱和支持，帮助其更好地康复。