龟头口红肿流脓，小便时刺痛，可能是以下原因引起：
1.尿道炎：由淋球菌或非淋球菌引起的尿道炎症。主要通过性接触传播，不洁性行为后常出现尿频、尿急、尿痛、尿道口红肿、尿道脓性分泌物等症状。治疗可选用头孢曲松钠、大观霉素等药物。治疗期间应避免性生活，同时性伴侣也应接受检查和治疗。
2.龟头炎：龟头和包皮内板的炎症。可由感染、局部刺激、外伤等因素引起。龟头炎可表现为龟头红斑、水肿、疼痛、脓性分泌物等。治疗方法包括保持局部清洁、干燥，外用抗生素软膏（如红霉素软膏、莫匹罗星软膏）等。如果感染严重，可口服抗生素（如头孢呋辛酯、左氧氟沙星）治疗。
3.前列腺炎：前列腺的炎症。可由细菌感染、免疫因素、盆底神经肌肉活动异常等引起。前列腺炎可出现尿频、尿急、尿痛、尿不尽、尿道口红肿、脓性分泌物等症状。治疗方法包括使用抗生素（如左氧氟沙星、头孢克洛）、α受体阻滞剂（如坦索罗辛）、非甾体抗炎镇痛药（如塞来昔布）等。此外，还可采用前列腺按摩、生物反馈治疗等方法。
4.其他：尿道口结石、尿道憩室感染、尿道肉阜感染等也可能导致龟头口红肿流脓、小便刺痛。
如果出现龟头口红肿流脓、小便刺痛的症状，应及时就医，进行相关检查（如尿道分泌物涂片、培养、药敏试验，前列腺液检查等），明确病因，并根据具体情况选择合适的治疗方法。同时，应注意个人卫生，保持尿道口清洁，避免不洁性行为。