二甲双胍是治疗多囊卵巢综合征的常用药物之一，但它可能会引起一些副作用，如胃肠道不适、维生素B12缺乏、乳酸酸中毒等。如果副作用较大，患者可以考虑以下药物替代：
1.胰岛素增敏剂：如罗格列酮、吡格列酮等，可增加细胞对胰岛素的敏感性，降低胰岛素抵抗，从而改善多囊卵巢综合征的症状。
2.促排卵药物：如氯米芬、来曲唑等，可促进卵泡发育和排卵，帮助患者受孕。
3.中药：一些中药也可用于治疗多囊卵巢综合征，如当归、熟地、白芍等，具有调经、补血、养颜等功效。
需要注意的是，不同的药物有不同的适应症、禁忌症和副作用，患者应在医生的指导下选择合适的药物，并严格按照医嘱用药。此外，除了药物治疗外，多囊卵巢综合征患者还需要注意饮食、运动、心理等方面的调节，保持健康的生活方式。