怀孕初期小便时小腹两侧疼可能是正常的生理现象，也可能是某些疾病的表现，以下是一些可能的原因和建议：
1.子宫增大：怀孕初期，子宫会逐渐增大，以适应胚胎的生长。在这个过程中，可能会牵拉子宫两侧的韧带，引起小腹两侧疼痛。这种疼痛通常是轻微的，并且会随着孕周的增加而逐渐缓解。建议多休息，避免剧烈运动和性生活。
2.泌尿系统感染：怀孕后，女性的泌尿系统容易受到感染，尤其是尿道炎和膀胱炎。这些感染可能导致小便时小腹两侧疼痛，同时还可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状。建议及时就医，进行尿液检查和治疗。常用的抗感染药物有阿莫西林、头孢呋辛酯等。
3.先兆流产：怀孕初期，如果出现小腹两侧疼痛，并伴有阴道流血，可能是先兆流产的迹象。这种情况需要及时就医，进行超声检查和孕酮、人绒毛膜促性腺激素等检查。如果确诊为先兆流产，需要卧床休息，并在医生的指导下进行保胎治疗。
4.其他原因：除了上述原因外，怀孕初期小便时小腹两侧疼还可能与其他因素有关，如肠痉挛、疝气等。
需要注意的是，如果疼痛持续加重或伴有其他异常症状，如高热、呕吐、腹泻等，应及时就医，以排除其他严重疾病的可能。同时，在怀孕期间，应注意个人卫生，保持外阴清洁，避免感染。如果对怀孕初期的身体变化有任何疑问或担忧，建议及时咨询医生。