扁桃体炎多由乙型溶血性链球菌感染引起，此外，葡萄球菌、肺炎链球菌、流感嗜血杆菌等也可引起本病。甲硝唑主要用于治疗或预防上述厌氧菌引起的系统或局部感染，如腹腔、消化道、女性生殖系、下呼吸道、皮肤及软组织、骨和关节等部位的厌氧菌感染，对于扁桃体炎的治疗效果有限，因此不建议使用甲硝唑治疗扁桃体炎。
对于急性扁桃体炎患者，通常以抗生素治疗为主，首选青霉素，根据病情轻重决定给药途径。如果患者对青霉素过敏，可选用红霉素、林可霉素等。此外，还可根据患者症状给予对症治疗，如有发热，可使用解热镇痛药；如有咽痛剧烈，影响吞咽，可使用糖皮质激素。
对于慢性扁桃体炎患者，目前尚无有效的保守疗法，可在急性发作时进行上述治疗。如果扁桃体炎反复急性发作，或有扁桃体周围脓肿病史，或扁桃体过度肥大，影响呼吸、吞咽等功能时，可考虑手术治疗。
需要注意的是，使用抗生素治疗时，需严格遵循医嘱，按照剂量和疗程使用，避免滥用。同时，在治疗期间应注意休息，保持口腔清洁，多饮水，避免食用辛辣、刺激性食物。如果症状加重或出现其他不适，应及时就医。