子宫内膜异位症的病因尚不清楚，目前认为可能与以下因素有关：
1.经血逆流：月经期，经血从子宫腔经输卵管倒流进入盆腔，种植在卵巢和盆腔腹膜上，以及子宫肌层。
2.医源性种植：进行剖宫产、人工流产、输卵管通液等妇科手术时，子宫内膜碎片可能被带入腹腔，种植在盆腔脏器上。
3.淋巴及静脉播散：子宫内膜可通过淋巴或静脉播散到远离盆腔的部位，如肺部、四肢等。
4.体腔上皮化生：女性的腹膜、胸膜、心包膜等均由体腔上皮分化而来，当子宫内膜异位到这些部位时，可能会在该处生长、浸润、反复出血，形成病灶。
5.遗传因素：约10%的子宫内膜异位症患者有家族遗传史，提示该病可能与遗传因素有关。
6.免疫因素：子宫内膜异位症患者的腹腔液中巨噬细胞数量明显高于正常妇女，且其吞噬功能亢进，可能导致局部免疫功能异常，从而促进子宫内膜异位症的发生。
7.环境因素：研究发现，长期暴露于高浓度的雌激素环境中，可能增加子宫内膜异位症的发病风险。