先天性甲状腺功能低下症是由于甲状腺激素合成不足所导致的疾病，主要治疗方法如下：
1.甲状腺素替代治疗：这是先天性甲状腺功能低下症的主要治疗方法。通过给予患者适量的甲状腺素，补充体内甲状腺激素的不足，维持正常的生理功能。常用的甲状腺素药物有左旋甲状腺素钠等。
2.定期监测：患者需要定期到医院进行甲状腺功能的监测，以便调整甲状腺素的剂量。医生会根据患者的年龄、体重、甲状腺功能等因素，制定个性化的治疗方案。
3.饮食调整：在治疗过程中，患者需要注意饮食调整。适当增加碘的摄入，如食用含碘盐、海带、紫菜等食物。
4.治疗并发症：先天性甲状腺功能低下症患者可能会出现一些并发症，如心脏功能异常、生长发育迟缓等。医生会根据患者的具体情况，进行相应的治疗和管理。
5.健康教育：患者和家属需要了解疾病的相关知识，包括治疗方法、注意事项等。同时，要注意观察孩子的生长发育情况，如有异常及时就医。
需要注意的是，先天性甲状腺功能低下症的治疗需要长期坚持，患者和家属应积极配合医生的治疗，定期复查，以确保孩子的健康成长。