​流行性出血热肾损害潜伏期为4到46天，病程主要包括发热期、低血压期、少尿期，多尿期和恢复期。非典型和轻型的病例可以出现越期的现象，重症患者可以出现二期和三期的相互重叠。临床症状包括各种出血症状，循环衰竭，肾损害。损害的主要表现是急性肾衰竭，主要的病理改变包括肾血流不足，肾小球和肾小管基膜的损伤，起病多急骤，发热通常39到40度，以稽留热及弛张热为多见，持续三到七天，也有达十天以上的。可以有头痛、眼眶痛，腰背痛，肌肉酸痛，困倦无力，还有胃肠道症状。低血压期，病程的第四到六日时可出现，持续几小时到两天，也可以达六天以上，可以出现低血压和休克，并发急性肾功能衰竭。第三是少尿期，发生在病程的第五到八日，持续三到七天。多尿期一般出现在病程的九到十四日，持续几天到几周。恢复期一般持续两到三个月。