甲磺酸帕珠沙星氯化钠和盐酸左氧氟沙星胶囊都是临床上常用的抗生素，下面是这两种药物的差别：
1.化学结构：甲磺酸帕珠沙星氯化钠是第四代喹诺酮类抗菌药，盐酸左氧氟沙星胶囊是第三代喹诺酮类抗菌药。
2.抗菌谱：甲磺酸帕珠沙星氯化钠对革兰氏阳性菌、阴性菌均有抗菌作用，尤其对需氧的革兰氏阴性菌的抗菌活性更强，包括大肠埃希菌、克雷伯菌属、变形杆菌属、铜绿假单胞菌等；盐酸左氧氟沙星胶囊对革兰氏阳性菌、阴性菌中的厌氧菌和非典型病原体也有较强的抗菌活性，如肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、淋病奈瑟菌等。
3.药代动力学：甲磺酸帕珠沙星氯化钠静脉滴注后吸收迅速，血药浓度达峰时间为1小时左右，消除半衰期为3.69小时；盐酸左氧氟沙星胶囊口服吸收良好，血药浓度达峰时间为1小时左右，消除半衰期为6-7小时。
4.适应症：甲磺酸帕珠沙星氯化钠主要用于治疗敏感细菌引起的呼吸系统、泌尿系统、胆道、皮肤软组织感染等；盐酸左氧氟沙星胶囊主要用于治疗敏感细菌引起的呼吸系统、泌尿系统、生殖系统、皮肤软组织感染等。
5.不良反应：甲磺酸帕珠沙星氯化钠的不良反应主要有胃肠道反应、皮疹、瘙痒、注射部位疼痛等；盐酸左氧氟沙星胶囊的不良反应主要有胃肠道反应、头痛、眩晕等。
6.注意事项：对喹诺酮类药物过敏者禁用；肾功能不全者需根据肌酐清除率调整剂量；孕妇及哺乳期妇女慎用；与其他药物可能存在相互作用，需在医生指导下使用。
需要注意的是，以上信息仅供参考，具体用药请在医生的指导下进行。