三个月没有来月经，可能是以下原因导致的：
1.怀孕：如果有性生活且没有采取避孕措施，三个月没来月经首先要考虑怀孕的可能。可以通过验孕棒或早孕试纸检测，也可以去医院抽血检查β-hCG确诊。
2.内分泌失调：下丘脑-垂体-卵巢轴的功能不稳定或是有缺陷，即月经病。如果长期处于压力下、作息时间不规律、过度节食减肥或服用一些药物，都可能会导致内分泌失调，从而影响月经周期。此外，一些全身性疾病如甲状腺功能亢进、糖尿病等也可能会导致月经不来。
3.多囊卵巢综合征：这是一种常见的妇科内分泌疾病，以雄激素过高、持续无排卵、卵巢多囊改变为特征，常伴有胰岛素抵抗和肥胖。主要表现为月经失调（月经稀发或闭经）、不孕、多毛、痤疮等。
4.卵巢早衰：指卵巢功能衰竭所导致的40岁之前即闭经的现象。其原因可能是遗传因素、自身免疫性疾病、医源性因素等。卵巢早衰会导致雌激素水平下降，从而出现月经稀发、闭经等症状。
5.其他：子宫内膜受损、宫腔粘连、子宫内膜炎等也可能导致月经不来。此外，一些慢性疾病，如贫血、慢性肝炎、结核病等，也可能会影响月经。
如果三个月没有来月经，建议及时就医，进行相关检查，以明确原因，并采取相应的治疗措施。