三个月没来月经可能由以下原因引起：
1.怀孕：有性生活的女性，一旦月经推迟，首先要考虑是否怀孕。可自行购买验孕棒或早孕试纸检测，如结果为阳性，建议进一步去医院复查，明确诊断。
2.内分泌失调：长期的精神压力、情绪波动、环境改变等因素，可能影响内分泌，导致月经失调。此外，一些疾病，如多囊卵巢综合征、高泌乳素血症等，也可能导致内分泌失调，引起停经。
3.卵巢功能衰退：随着年龄的增长，卵巢功能逐渐衰退，雌激素水平下降，可能导致月经紊乱，甚至停经。这种情况常见于绝经前期的女性。
4.其他因素：一些全身性疾病，如贫血、营养不良、慢性肝炎、肾炎、肿瘤等，也可能导致月经失调。此外，宫腔手术、服用某些药物等，也可能引起停经。
需要注意的是，以上只是一些常见的原因，停经三个月还可能有其他原因。如果排除了怀孕，建议及时就医，进行详细的检查，以明确停经的原因，并采取相应的治疗措施。此外，对于青春期少女、更年期女性以及长期停经的女性，更应重视停经问题，及时就医，以排除潜在的健康隐患。