小肚子两侧隐隐作痛可能是由多种原因引起的，以下是一些可能的原因和建议：
1.盆腔炎：盆腔炎是女性上生殖道感染引起的一组疾病，包括子宫内膜炎、输卵管炎、输卵管卵巢脓肿和盆腔腹膜炎。炎症可局限于一个部位，也可同时累及几个部位，以输卵管炎、输卵管卵巢炎最常见。多发生在性活跃期、有月经的妇女，初潮前、绝经后或未婚者很少发生盆腔炎。若发生盆腔炎，可能会出现小肚子两侧隐痛、下坠、白带增多等症状。治疗方法包括使用抗生素、手术等，同时注意个人卫生，避免过度劳累和性生活。
2.附件炎：附件炎是指输卵管和卵巢的炎症。分急、慢性两种。细菌可经血行传播、经期卫生不良、产后或流产后感染等均可引起附件炎。当发生附件炎时，患者常常会感到下腹部坠胀、疼痛及腰骶酸痛等，且往往在经期或劳累后加重。妇科检查时双侧或单侧附件区压痛，增厚感，或出现压痛性的包块，白细胞数目升高或正常。急性附件炎如果治疗不及时或治疗不彻底，可转为慢性附件炎。治疗附件炎的方法包括使用抗生素、物理治疗等。
3.异位妊娠：受精卵在子宫体腔以外着床称为异位妊娠，习称宫外孕。异位妊娠以输卵管妊娠最常见。病因常由于输卵管管腔或周围的炎症，引起管腔通畅不佳，阻碍孕卵正常运行，使之在输卵管内停留、着床、发育，导致输卵管妊娠流产或破裂。在流产或破裂前往往无明显症状，也可有停经、腹痛、少量阴道出血。破裂后表现为急性剧烈腹痛，反复发作，阴道出血，以至休克。异位妊娠是妇产科常见的急腹症之一，若不及时诊断和治疗，可能会危及生命。如果怀疑异位妊娠，应及时就医，进行B超、血HCG等检查，以明确诊断。治疗方法包括手术治疗和药物治疗，具体治疗方法应根据病情而定。
4.排卵性腹痛：在月经中期，即排卵期，由于卵泡破裂，卵泡液对腹膜的刺激，有些女性会出现下腹疼痛，这是一种正常的生理现象，一般持续1-2天即可消失。如果腹痛剧烈，或持续时间较长，应及时就医，排除其他疾病的可能。
5.其他：小肚子两侧隐痛还可能与其他疾病有关，如子宫内膜异位症、子宫肌瘤、宫颈炎等。如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如发热、恶心、呕吐、阴道出血等，应及时就医，进行详细的检查和诊断，以明确病因，并进行相应的治疗。
总之，小肚子两侧隐痛可能是一种正常的生理现象，也可能是一种疾病的表现。如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，应及时就医，进行详细的检查和诊断，以明确病因，并进行相应的治疗。