新型冠状病毒核酸检测做两次的主要原因有以下几点：
1.提高检测准确性：新型冠状病毒的检测方法主要是核酸检测，通过检测样本中是否存在病毒的核酸来判断是否感染。但核酸检测可能会出现假阴性的情况，即感染者在第一次检测时结果为阴性，但实际上已经感染了病毒。这可能是因为采样不规范、样本质量差、病毒载量低等原因导致。因此，通过两次检测可以提高检测的准确性，减少假阴性的出现。
2.排除假阳性：核酸检测也可能会出现假阳性的情况，即没有感染病毒的人在第一次检测时结果为阳性。这可能是因为采样过程中受到其他病原体的污染、检测试剂的质量问题、实验室操作不当等原因导致。因此，通过两次检测可以排除假阳性的情况，提高检测的可靠性。
3.便于疫情防控：对于密切接触者、疑似病例、确诊病例等重点人群，需要进行多次核酸检测。通过两次检测可以更好地了解病毒的传播情况和患者的病情变化，便于疫情防控部门采取相应的措施，如隔离、治疗等。
4.不同检测方法的互补：目前，新型冠状病毒核酸检测的方法有多种，如实时荧光RT-PCR法、恒温扩增芯片法等。不同的检测方法可能具有不同的灵敏度和特异性，通过两次检测可以使用不同的方法进行互补，提高检测的准确性。
总之，新型冠状病毒核酸检测做两次是为了提高检测的准确性和可靠性，排除假阳性和假阴性的情况，便于疫情防控部门采取相应的措施。同时，在进行核酸检测时，需要注意采样的规范、样本的质量、实验室的操作等因素，以保证检测结果的准确性。