早上起来眼睛疼可能由多种原因引起，包括熬夜、眼部疲劳、结膜炎等，需依据具体原因进行针对性治疗。
一、熬夜：若长时间熬夜，眼部易出现充血和水肿，患者可能有眼部肿胀、疼痛等不良表现。对此，可通过多休息并养成良好作息规律来改善，比如保持充足的睡眠时间，每天按时入睡和起床等。
二、眼部疲劳：长时间观看电子产品可能使眼部疲劳，导致眼睛出现酸涩症状，进而在早上起床时容易感觉眼睛疼痛。此时，通过按摩和热敷能缓解症状，按摩可促进眼部血液循环，热敷则能舒缓眼部肌肉紧张。
三、结膜炎：通常由细菌性感染引发，会使眼部结膜发炎，可能伴有充血、疼痛等状况。可在医生指导下使用盐酸左氧氟沙星滴眼液、加替沙星滴眼液等药物进行治疗，这些药物能起到抗菌消炎的作用，帮助缓解炎症和疼痛。
此外，青光眼也可能导致早上起来眼睛疼，这就需要配合医生积极治疗。
总之，早上起来眼睛疼的原因多样，应明确原因后采取适宜的治疗方法。同时，要注意保护眼睛，避免过度用眼和不良的用眼习惯。