脂肪肝的药物治疗需根据具体情况选择，一般来说，对于单纯性脂肪肝，可能暂时不需要药物治疗，但对于伴有代谢异常等情况的脂肪肝，可能会用到一些药物。目前常用的针对脂肪肝相关代谢异常的药物有奥利司他等，不过药物治疗只是一方面，还需结合生活方式调整等。
针对代谢综合征相关药物
改善胰岛素抵抗药物： 比如二甲双胍，它可以增加外周组织对葡萄糖的摄取和利用，改善胰岛素抵抗，对于伴有2型糖尿病等胰岛素抵抗情况的脂肪肝患者可能适用，但需在医生指导下使用，且要注意监测血糖等指标。调脂药物： 若脂肪肝患者伴有高脂血症，可能会用到他汀类药物，如阿托伐他汀等，这类药物可以降低血脂，稳定斑块，但使用时要关注肝功能等情况，因为部分他汀类药物可能对肝脏有一定影响，不过在密切监测下可合理应用。
保肝抗炎药物
多烯磷脂酰胆碱： 它可以保护肝细胞膜，促进肝细胞修复和再生，对于脂肪肝引起的肝细胞损伤有一定的保护作用，能改善肝脏的代谢功能等。水飞蓟素： 具有抗氧化和稳定肝细胞膜的作用，可减轻脂肪肝导致的肝脏炎症和损伤，有助于改善肝功能指标。
特殊人群用药注意
儿童脂肪肝： 儿童脂肪肝多与肥胖等因素相关，一般不首先考虑药物治疗，主要通过调整饮食（减少高热量、高脂肪食物摄入，增加蔬菜、水果等富含膳食纤维食物的摄入）和增加运动来干预，不建议随意使用成人的降血脂或保肝药物，因为儿童的肝肾功能等发育尚未完全成熟，药物可能带来额外风险。孕妇脂肪肝： 孕妇出现脂肪肝情况较为特殊，一般不轻易使用药物治疗，主要通过调整饮食结构（保证营养均衡的同时控制热量摄入）、适当运动等方式来改善，必须用药时需由医生综合评估孕妇和胎儿的情况，谨慎选择对胎儿影响较小的药物。