脑膜炎后遗症的表现多样，比如部分患者可能会出现智力减退，有研究显示约10% - 20%的脑膜炎患者会遗留不同程度的智力下降问题。
神经系统方面的表现
认知功能障碍： 患者可能出现记忆力减退，尤其是近期记忆力下降明显，对于刚发生的事情容易遗忘。还可能有注意力不集中的情况，在学习或工作中很难长时间专注。运动功能异常： 有的患者会出现肢体运动障碍，比如一侧肢体肌力下降，活动不灵活，严重的可能导致行走困难，需要借助辅助器具才能行走。部分患者还可能出现不自主的肢体抖动等运动异常表现。
精神方面的表现
情绪障碍： 脑膜炎后遗症患者可能出现情绪不稳定，容易焦虑、抑郁。比如经常无端感到紧张、担忧，或者情绪低落，对原本感兴趣的事情提不起兴趣。行为异常： 有些患者会出现行为改变，例如性格变得孤僻，不愿意与人交流沟通，或者出现一些怪异的行为举止，像反复做同一个无意义的动作等。
其他方面的表现
癫痫发作： 约有5% - 20%的脑膜炎患者会在后遗症期出现癫痫发作。发作形式多样，可能是全身性大发作，表现为突然意识丧失、四肢抽搐、口吐白沫等；也可能是部分性发作，出现身体某一局部的抽搐等症状。视力听力问题： 部分患者会有视力下降的情况，可能是视神经受损导致；还有些患者会出现听力减退，影响正常的交流沟通。