脑膜炎后遗症表现多样，比如部分患者可能出现认知功能障碍，有研究显示约10% - 30%的脑膜炎患者会遗留不同程度的认知问题，像记忆力减退、注意力不集中等。
神经系统方面表现
智力减退： 一些脑膜炎患者康复后可能出现智力较患病前下降的情况，轻者表现为对新事物的学习能力变弱，严重的可能影响日常生活中的基本认知和判断。运动功能障碍： 部分患者会有肢体运动方面的问题，比如肢体瘫痪，常见的是单侧肢体无力，无法正常完成抬手、走路等动作；还有可能出现共济失调，表现为走路不稳，像喝醉酒一样摇摇晃晃。
癫痫发作
发作形式多样： 脑膜炎后遗症可能引发癫痫，发作形式有多种，如全身性强直 - 阵挛发作，表现为突然意识丧失，全身肌肉强直收缩后接着出现阵挛性抽搐；还有部分性发作，可能只是身体某一局部的抽搐，比如面部肌肉抽搐等。而且癫痫发作的频率因人而异，有的患者可能几个月发作一次，有的则可能频繁发作。
精神行为异常
情绪改变： 患者可能出现情绪方面的异常，比如长期处于抑郁状态，情绪低落，对很多事情提不起兴趣；也有的会变得易激惹，稍微有点刺激就容易发怒。行为异常： 部分患者会有行为上的改变，例如出现刻板行为，反复做同一个动作，像不停地揉搓手指等；还有可能出现睡眠障碍，睡眠的时间和质量都受到影响，比如入睡困难、睡眠浅、多梦等。