灰指甲医学上称为甲癣，目前并没有被科学验证的可靠土方法能有效治疗。甲癣是由皮肤癣菌等真菌侵犯甲板或甲下所引起的疾病，治疗需要正规的医疗手段。
外用药物的情况
碘伏涂抹： 碘伏有一定的杀菌作用，但单独用碘伏治疗灰指甲效果有限。因为碘伏很难渗透到甲板内部，而甲癣的真菌常常藏在甲板下，单纯涂抹碘伏不能彻底杀灭真菌。醋泡： 有人用醋泡指甲来治灰指甲，醋的酸性可能在一定程度上抑制真菌，但效果不确切。而且长时间用醋泡可能会刺激皮肤，导致皮肤发红、疼痛等不适。
口服药物的正规情况
正规治疗甲癣可以口服抗真菌药物，比如伊曲康唑。伊曲康唑是一种广谱抗真菌药，但口服抗真菌药有一定的适应证和禁忌证，需要在医生指导下使用，因为这类药物可能会对肝脏等有一定影响，用药前需要检查肝功能等情况，不是随便就能吃的。
手术治疗相关
拔甲术： 过去有拔甲的治疗方法，但现在已较少采用。拔甲需要局部麻醉等，而且拔甲后新长出来的指甲也有可能再次被真菌感染，并且拔甲过程中如果操作不当还可能引起感染等并发症。需要注意的是，民间流传的很多土方法没有科学依据，不能替代正规的医疗治疗。如果怀疑自己有灰指甲，应该及时到医院皮肤科就诊，医生会根据病情的严重程度等制定正规的治疗方案，比如根据是单发还是多发的甲癣，是远端侧位甲下型还是白色浅表型等不同类型来选择合适的治疗方法，可能是外用抗真菌药联合口服药，或者单纯口服药等。同时，在治疗过程中要注意个人卫生，保持足部或手部的清洁干燥，避免与他人共用拖鞋、毛巾等物品，防止交叉感染。