灰指甲是由皮肤癣菌等真菌侵犯甲板或甲下所引起的疾病，不建议使用所谓的“土方法”治疗，因为很多土方法缺乏科学依据，可能延误病情或导致病情加重。正规治疗一般包括外用药物和口服药物等。比如外用抗真菌药物，像阿莫罗芬搽剂，每周使用1 - 2次，但一般需要连续使用数月。
外用药物情况
碘伏涂抹： 碘伏有一定的杀菌作用，不过单独用碘伏治疗灰指甲效果有限。可以用碘伏先清洁病甲周围皮肤，再涂抹，但要坚持使用较长时间，而且很难彻底治愈灰指甲。白醋浸泡： 可以将指甲浸泡在白醋里，白醋有一定酸性，可能对真菌有一定抑制作用，但同样不能单纯依靠白醋来治好灰指甲，浸泡时间一般每次15 - 30分钟，每天可能需要浸泡数次，但效果不确切。
口服药物相关
特比萘芬： 是一种口服抗真菌药，能抑制真菌细胞膜的合成，但2岁以下儿童禁用，成人服用时要注意监测肝功能等。不过不建议自行盲目使用口服抗真菌药，需要在医生评估后，符合用药指征才会使用。伊曲康唑： 也是口服抗真菌药，使用时需要遵循冲击疗法等用药方案，但同样有一定的禁忌证，比如严重肝肾功能不全者禁用，也不能自行随意使用。
日常注意事项
保持足部干燥： 真菌容易在潮湿环境中滋生，所以要经常换袜子，保持脚部干燥，穿透气的鞋子，这样可以减少真菌生长的环境，有助于灰指甲的控制，但不能替代正规治疗。避免共用物品： 灰指甲具有传染性，要避免与他人共用拖鞋、脚盆等物品，防止将真菌传染给他人，也能防止自身其他指甲被感染。