长期反复口腔溃疡可能由多种原因引起。一般来说，复发性阿弗他溃疡较为常见，其发病可能与遗传、免疫、环境等多种因素有关，有研究显示约40%的患者有家族遗传倾向。
一、局部因素导致
创伤性口腔溃疡： 如果口腔内有残根、残冠，或者牙齿的锐利边缘，长期摩擦口腔黏膜就容易引发反复口腔溃疡。比如有尖锐的残根，持续刺激对应的牙龈或颊黏膜，就会不断出现溃疡。口腔局部感染： 像白色念珠菌感染，就可能导致反复口腔溃疡。尤其是一些免疫力较低的人群，或者长期使用抗生素、激素的人，更容易受到白色念珠菌的侵袭而出现反复口腔溃疡情况。
二、全身因素引发
免疫系统异常： 当人体免疫系统出现问题时，比如患有白塞病，就会出现长期反复口腔溃疡，同时还可能伴有生殖器溃疡、眼部病变等。白塞病是一种慢性自身免疫性疾病，会累及多个系统。维生素或微量元素缺乏： 缺乏维生素B族、铁、锌等也可能引起长期反复口腔溃疡。例如，长期偏食、饮食不均衡的人，很容易出现维生素B2缺乏，进而导致口腔溃疡反复发生。一般来说，人体每天需要摄入一定量的维生素B2，缺乏时就易出现口腔问题。
三、其他因素影响
精神因素： 长期精神紧张、焦虑、压力过大等也可能诱发长期反复口腔溃疡。比如一些学生在考试期间，由于精神高度紧张，就容易出现口腔溃疡反复发作的情况。内分泌变化： 女性在月经前后，体内激素水平发生变化，也可能出现长期反复口腔溃疡。这是因为激素变化会影响口腔黏膜的代谢等过程，从而导致溃疡反复出现。