肠息肉形成的原因较为复杂，一般认为多种因素共同作用导致其形成。比如，遗传因素就可能参与其中，有家族性腺瘤性息肉病等遗传性息肉病家族史的人群，患病风险比普通人高。
遗传因素相关
基因变异影响： 某些基因突变会增加肠息肉的发生几率。例如，APC基因等的突变，可能使肠道上皮细胞异常增殖，从而容易形成息肉。有研究发现，家族性腺瘤性息肉病患者往往存在APC基因的胚系突变，这会导致肠道内大量腺瘤性息肉形成。家族聚集倾向： 如果家族中有亲属患肠息肉相关疾病，那么其他家族成员患肠息肉的可能性会比无家族史的人高。比如一个家庭中父母一方患有肠息肉，其子女患肠息肉的概率会比正常人群高出一定比例。
炎症刺激方面
肠道慢性炎症影响： 长期的肠道慢性炎症，如溃疡性结肠炎、克罗恩病等，会不断刺激肠道黏膜，使黏膜反复发生炎症反应，进而导致黏膜上皮异常增生，容易形成息肉。例如，溃疡性结肠炎患者病程超过10年以上，发生肠息肉的风险明显增加。感染因素关联： 一些肠道感染病原体也可能参与肠息肉的形成。比如幽门螺杆菌感染虽然主要与胃部疾病相关，但有研究发现其可能通过影响肠道微生态等途径，间接增加肠道息肉发生的可能性；还有某些病毒感染，也可能对肠道黏膜造成损伤，引发息肉形成。
生活方式因素
饮食因素影响： 长期高脂肪、低纤维饮食是肠息肉形成的危险因素之一。高脂肪饮食会使胆汁酸分泌增加，胆汁酸在肠道内经过细菌分解后可能产生一些致癌或促息肉形成的物质；而低纤维饮食会导致肠道蠕动减慢，粪便在肠道内停留时间延长，肠道黏膜与致癌物质接触时间增加，容易诱发息肉。例如，每天膳食纤维摄入不足25克的人群，相比摄入充足的人群，肠息肉发生率更高。吸烟与饮酒影响： 吸烟会增加肠道息肉的发生风险，烟草中的多种有害物质会损伤肠道黏膜，影响肠道正常的生理功能；过量饮酒也会对肠道黏膜造成刺激，破坏肠道微生态平衡，进而促进肠息肉形成。有研究表明，长期吸烟者患肠息肉的概率比不吸烟者高约30%左右。