心脏隔膜缺损主要通过手术治疗，一般小型的室间隔缺损有一定自愈可能，而大型的室间隔缺损通常需要在合适时机进行手术。对于房间隔缺损，也多需手术干预来修复缺损。
手术治疗方式
室间隔缺损手术：常见的有室间隔缺损修补术，一般在孩子3~6岁时进行较为合适，但如果缺损较大，出现严重症状，可能需要提前手术。手术是通过开胸或微创的方式，用补片等材料修复缺损的室间隔。房间隔缺损手术：有介入封堵术和外科修补术。介入封堵术适用于符合一定条件的患者，一般在患者年龄大于3岁，缺损大小合适等情况下可选择。外科修补术则是直接对房间隔缺损处进行缝合或补片修复。
非手术观察情况
小型室间隔缺损：有部分孩子在1岁内可能自愈。如果室间隔缺损较小，孩子没有明显的症状，如呼吸急促、反复肺炎等情况，可以定期复查心脏超声，观察缺损的变化情况。一般每3~6个月复查一次心脏超声，监测缺损是否有缩小或闭合的趋势。小型房间隔缺损：对于直径小于5毫米的房间隔缺损，也有一定的自愈可能。同样需要定期复查心脏超声，观察缺损的变化。如果在观察过程中，缺损没有闭合且孩子出现了一些症状，如活动后气促等，就需要考虑手术治疗。
术后注意事项
饮食方面：术后孩子需要注意营养均衡，保证充足的蛋白质、维生素等摄入。可以多吃一些富含蛋白质的食物，如鸡蛋、牛奶等，以及新鲜的蔬菜水果，以促进身体恢复。但要注意避免过度喂养，防止孩子体重增长过快增加心脏负担。活动方面：术后早期要限制孩子的剧烈活动，一般建议在术后1~3个月内避免剧烈运动，如跑步、跳绳等。随着身体恢复，可以逐渐增加活动量，但要避免长时间的劳累。一般术后3个月左右可以进行一些轻度的活动，如散步等，6个月后可根据恢复情况适当增加活动强度，但仍要避免重体力劳动。复查方面：术后需要按照医生的要求定期复查，一般术后1个月、3个月、6个月、1年都需要复查心脏超声等检查，以了解心脏恢复情况，如缺损是否完全修复、心脏功能是否正常等。