眼睛一大一小可能由多种原因引起。其中一种常见原因是先天性因素，比如先天性上睑下垂，据统计，先天性上睑下垂的发生率约为0.12%，这是由于提上睑肌发育不良或动眼神经核发育不全等导致一侧上睑抬起受限，从而出现双眼大小不一。
先天性因素导致
先天性眼睑发育异常： 有些婴儿出生时就存在眼睑的先天性结构差异，可能是一侧眼睑的组织结构发育与另一侧不同，使得眼睛外观上一大一小。比如一侧眼睑的皮肤、肌肉等组织发育异常，影响了眼睑的正常形态和功能。先天性眼球大小不一： 极少见的情况是先天性的眼球本身大小不同，这也会造成眼睛看起来一大一小，但这种情况相对比较罕见。
后天性因素导致
眼部疾病引起： 眼部的一些疾病可能导致眼睛一大一小。例如，一侧眼部发生炎症，如眼眶蜂窝织炎，炎症可能导致眼部组织肿胀，使患侧眼睛看起来变大；而如果是一侧眼部发生外伤，导致眼球萎缩，就会使患侧眼睛变小。另外，一侧眼部的肿瘤，无论是良性还是恶性肿瘤，都可能影响眼部组织的正常结构和形态，从而造成双眼大小差异。神经系统病变： 面神经麻痹是常见的神经系统问题，若一侧面神经麻痹，会导致患侧眼轮匝肌功能障碍，出现眼睑闭合不全等情况，从外观上看患侧眼睛可能相对较大或与另一侧有差异。还有动眼神经麻痹等，也可能影响眼部肌肉的运动，进而导致眼睛大小改变。生活习惯因素： 长期不良的用眼习惯也可能影响眼睛外观。比如长期侧卧睡觉，压迫一侧眼睛，可能在短时间内造成双眼暂时性的大小不一，但这种情况一般在纠正习惯后可逐渐恢复。不过如果长期保持不良习惯，也可能对眼部组织产生一定影响，导致长期的眼睛大小差异。