3岁宝宝晚上睡觉咳嗽的原因包括呼吸道感染、特殊感染、非感染性因素等。
一、呼吸道感染：
1.3岁宝宝的呼吸道尚未发育完全，容易受到外界病毒、细菌、支原体、衣原体等感染，从而导致夜间咳嗽。
2.针对原发疾病进行抗炎治疗和对症止咳治疗，能够有效缓解咳嗽症状。
二、特殊感染：
1.像结核感染等特殊感染也会引起夜间咳嗽，可能同时伴有低热、盗汗等表现。
2.需要及时进行结核检测，并开展抗结核治疗。此外，百日咳等少见疾病会出现夜间咳嗽加重的情况，需通过对症治疗来减轻症状。
三、非感染性因素：
1.如哮喘、过敏性咳嗽、胃食管反流等。胃食管反流者在夜间平卧时咳嗽症状可能加重；哮喘、过敏性咳嗽常在夜间发作，白天症状相对较轻。
2.临床需进行过敏检测，然后给予对症的抗过敏治疗。
如果出现3岁宝宝晚上睡觉咳嗽的情况，应尽快前往医院就诊，完善相关检查以明确病因，并积极配合医生进行治疗，同时要定期复查。
总之，当遇到3岁宝宝晚上睡觉咳嗽的情况时，要综合考虑各种可能的原因，通过专业的检查和诊断来确定具体病因，并采取针对性的治疗措施。