乙肝抗病毒常用药物有核苷（酸）类似物和干扰素类。目前临床中恩替卡韦和替诺福韦酯应用较广泛，一般规范用药能有效抑制乙肝病毒复制。比如恩替卡韦，多项研究显示，用药1年时，超80%的患者乙肝病毒DNA载量可低于检测下限。
核苷（酸）类似物类
恩替卡韦： 它能强效抑制乙肝病毒复制，对初治患者效果较好，长期使用耐药率较低，但需长期服用，不能随意停药。替诺福韦酯： 抗病毒作用强，耐药发生率低，也是常用的核苷（酸）类似物，对于肾功能有一定要求，用药前需评估肾功能情况。
干扰素类
普通干扰素： 需要每周皮下注射，不良反应相对较多，如流感样症状、骨髓抑制等，但有部分患者停药后可获得持久应答。一般成人常用剂量是每次3-5MU，每周3次。聚乙二醇干扰素： 每周注射一次，相对于普通干扰素，不良反应相对轻一些，疗效也较为持久，不过价格相对较高。
不同人群用药需注意
孕妇： 乙肝抗病毒药物在孕妇中的使用需非常谨慎，大部分核苷（酸）类似物不建议孕妇使用，需由肝病专科医生和产科医生共同评估病情后再决定是否用药及选择合适方案。儿童： 儿童乙肝抗病毒用药需严格遵循医嘱，选择合适的药物，并且要密切监测药物的不良反应以及儿童的生长发育情况。例如对于符合条件的儿童患者，会根据具体情况选择合适的核苷（酸）类似物，但剂量等需严格按照儿童体重等计算。肾功能不全患者： 服用替诺福韦酯等药物时，要密切监测肾功能，因为该药物可能对肾功能有一定影响，根据肾功能情况调整药物剂量或更换药物。