主动脉瓣关闭不全可致多种不良后果。例如，慢性重度主动脉瓣关闭不全患者，约20%在2年内会出现左心室功能不全相关症状，如呼吸困难等。
对心脏功能的影响
左心室容量负荷增加：主动脉瓣关闭不全时，舒张期主动脉内血液反流至左心室，使左心室舒张末期容量增加。长期如此，左心室会逐渐扩张，心肌肥厚。一般经过数年甚至更长时间，可能出现左心室收缩功能减退，影响心脏泵血功能。引发心力衰竭：随着病情进展，心脏功能进一步受损，就可能发展为心力衰竭。患者会出现活动耐力下降，严重时在静息状态下也会有呼吸困难、乏力、水肿等表现，影响生活质量和寿命。
对全身血液循环的影响
外周组织灌注不足：心脏泵血功能受影响后，全身各组织器官的血液灌注会减少。比如肾脏灌注不足时，可能出现尿量减少；脑部灌注不足则会导致头晕、黑矇等症状。肺循环淤血：当左心室功能减退，肺静脉回流受阻，会引起肺循环淤血。患者会有咳嗽、咳痰等症状，严重肺循环淤血时可出现粉红色泡沫痰，这是急性左心衰竭的典型表现之一。
对其他器官的间接影响
肝脏淤血：体循环淤血可导致肝脏淤血，引起肝大、肝区胀痛等不适，长期肝脏淤血还可能影响肝功能，出现肝功能异常相关表现。胃肠道淤血：胃肠道淤血会影响胃肠道的消化和吸收功能，患者可能出现食欲不振、腹胀、恶心、呕吐等症状，影响营养物质的摄取。