十六岁女性月经不规律，主要有以下几方面原因：
一、身体发育不成熟：月经的调节受到下丘脑、垂体、卵巢等多个部位的综合作用。十六岁女性正处于身体发育阶段，卵巢等器官发育尚未完全成熟。这种发育不成熟会导致月经周期不规律。不过，随着年龄的增长，身体逐渐发育成熟，月经不规律的情况通常会慢慢得到改善，一般无需进行特殊治疗。
二、不良生活方式：如果学习或生活压力较大，经常熬夜等，这些不良生活方式可能会引起内分泌紊乱，进而导致月经不规律。通常在调整心态、放松心情，保持规律的作息后，月经可逐渐恢复正常。
三、内分泌疾病：
1.多囊卵巢综合征：可能会影响激素水平，从而影响月经周期，导致十六岁女生月经不规律。此时建议抽血检测，以明确激素的具体水平，从而确定月经不规律的原因。如果是多囊卵巢综合征导致，女生可遵医嘱使用地屈孕酮片等进行治疗。
2.高泌乳素血症：同样可能影响激素水平，造成月经不规律。若为此种情况导致，女生可遵医嘱使用甲磺酸溴隐亭片等进行治疗。
总之，十六岁女性月经不规律的原因较为多样，需要根据具体情况进行分析和处理。如果月经不规律的情况持续存在或伴有其他异常症状，应及时就医，以便明确原因并采取相应的治疗措施。