尿路感染通常是由细菌感染引起的，其中最常见的是大肠埃希菌，约占尿路感染病原菌的80%~90%。
病原体入侵途径
上行感染： 这是最主要的感染途径。细菌由尿道上行进入膀胱，甚至可沿输尿管向上蔓延至肾脏。比如女性尿道短而宽，且靠近肛门，大肠杆菌更容易通过尿道逆行进入膀胱引发感染。血行感染： 较少见。细菌从身体其他部位的感染灶经血运传播至泌尿系统引起感染。例如，皮肤感染、疖肿等病灶中的细菌可通过血液循环到达肾脏引发感染，但这种情况相对少见。
易感因素
女性生理结构： 女性尿道短（约3 - 5厘米）、直，距离肛门近，细菌容易侵入。据统计，女性一生中患尿路感染的概率较高，约为男性的8 - 10倍。比如性生活时，容易将尿道口周围的细菌挤入膀胱引发感染。泌尿系统结构或功能异常： 如尿路结石、狭窄、肿瘤等，会导致尿液引流不畅，细菌容易在局部滋生繁殖引发感染。例如，尿路结石会阻碍尿液的正常流动，使尿液滞留，为细菌生长提供了有利环境。机体免疫力低下： 如糖尿病患者、长期使用免疫抑制剂的人群，机体抵抗力下降，容易发生尿路感染。糖尿病患者由于血糖升高，尿液中含糖量增加，有利于细菌生长繁殖；长期使用免疫抑制剂会削弱身体的免疫防御功能，使身体更容易被细菌侵袭。
其他诱发因素
不良生活习惯： 不注意个人卫生，尤其是会阴部清洁不到位；长期憋尿，会使尿液在膀胱内停留时间过长，细菌大量繁殖；过度劳累等都可能增加尿路感染的风险。比如长期憋尿会导致膀胱内压力增高，影响膀胱壁的血液循环，降低膀胱的抵抗力，容易引发感染。医源性因素： 如导尿、膀胱镜检查等侵入性操作，可能会将细菌带入泌尿系统，破坏尿路黏膜的防御屏障，从而引起尿路感染。在进行导尿操作时，如果消毒不严格，就很容易导致细菌感染。