婴儿乳糖不耐受主要有消化道症状、非消化道症状等表现。一般来说，婴儿乳糖不耐受的消化道症状较为常见，约有很多婴儿会出现此类表现。
消化道方面的症状
腹泻表现： 婴儿可能会出现每日数次甚至10余次的腹泻，大便多为黄色或青绿色稀糊便，或呈蛋花汤样，有泡沫，还可能带有奶瓣。例如有的婴儿一天腹泻7 - 8次，大便性状明显异常。腹胀情况： 婴儿的小肚子会鼓鼓的，看起来比较胀，这是因为肠道内气体增多，乳糖不能被正常消化吸收，在肠道内被细菌发酵产生气体，导致腹胀。
非消化道方面的症状
哭闹不安： 婴儿因为肚子不舒服，会频繁哭闹，怎么哄都不容易安抚下来。这是因为肠道不适引起的身体上的难受，通过哭闹来表达。呕吐现象： 有的婴儿会出现呕吐，呕吐物多为奶液，可能还伴有未消化的奶瓣。这是由于肠道功能紊乱，影响了正常的消化和排空。
其他可能表现
生长发育可能受影响： 如果婴儿长期乳糖不耐受，营养吸收不好，可能会影响生长发育，体重增长可能比正常婴儿慢。比如正常婴儿在相同月龄下体重应该达到一定数值，而乳糖不耐受的婴儿可能低于该数值范围。肛周皮肤变化： 由于频繁腹泻，粪便对婴儿肛周皮肤刺激较大，可能会出现肛周皮肤发红、糜烂等情况，因为粪便中的酸性物质等会损伤皮肤。