婴儿乳糖不耐受主要表现为消化系统相关症状。通常婴儿乳糖不耐受时，会出现腹泻症状，每日腹泻次数可能达到数次到十数次不等，大便多为黄色或青绿色稀糊便，或呈蛋花汤样，泡沫多，有奶块。
消化系统症状表现
腹泻表现： 婴儿乳糖不耐受最常见的就是腹泻，大便次数较多，一般每天可能有3 - 10次左右，大便性状多为稀便，可能伴有奶瓣。比如有的婴儿一天腹泻5 - 7次，大便呈水样。腹胀情况： 婴儿还可能出现腹胀，肚子看起来鼓鼓的，有的婴儿会因为腹胀而哭闹不安。这是因为乳糖不能被正常消化吸收，在肠道内被细菌分解发酵，产生气体，导致腹胀。
其他伴随症状
呕吐现象： 部分婴儿会有呕吐的情况，呕吐物多为吃进去的奶液，呕吐次数不定，有的婴儿可能偶尔吐一次，有的则频繁呕吐。哭闹不安： 由于身体不适，婴儿会比平常更哭闹，尤其是在吃奶后，因为吃奶会加重乳糖不耐受的不适，所以婴儿会通过哭闹来表达难受。比如婴儿在吃奶后不久就开始大声哭闹，怎么安抚都不太管用。
不同类型的表现差异
原发性乳糖不耐受： 多见于先天性乳糖酶缺乏的婴儿，从出生后就可能出现症状，一直持续存在。比如一些先天性乳糖酶缺乏的婴儿，自出生后吃奶就会出现腹泻、腹胀等乳糖不耐受表现。继发性乳糖不耐受： 往往是因为一些疾病导致肠黏膜受损，从而引起乳糖酶暂时性缺乏，比如婴儿感染了轮状病毒等引起肠炎后，就可能出现继发性乳糖不耐受。一般在肠炎恢复后的一段时间内，乳糖不耐受的症状可能还会持续，比如肠炎康复后1 - 2周内，婴儿可能 still 存在乳糖不耐受的表现。