阴茎根部起小疙瘩，可能与多种原因有关，以下是一些常见的情况：
1.毛囊炎：阴毛部位的毛囊容易受到细菌感染，引起炎症，出现红色丘疹，有时顶部会有白色脓疱，伴有疼痛和瘙痒。
2.皮脂腺异位症：正常皮脂腺分布的部位，出现了散在的皮脂腺增生，表现为针尖至粟粒大小的半球形丘疹，颜色微黄，可密集分布但不融合，无自觉症状。
3.传染性软疣：由传染性软疣病毒感染引起，表现为半球形丘疹，质地较软，可挤出乳酪样物质，有传染性，可通过直接接触或间接接触传播。
4.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒感染引起，主要通过性接触传播，表现为菜花状或乳头状赘生物，表面湿润，触碰易出血。
5.阴茎珍珠状丘疹：常见于龟头边缘，与局部刺激或生理发育有关，表现为珍珠状、半透明丘疹，环绕龟头排列成一行或多行，无明显自觉症状。
6.其他：湿疹、扁平苔藓、鲍温样丘疹病等也可能导致阴茎根部起小疙瘩。
如果发现阴茎根部起小疙瘩，建议及时就医，医生会根据具体情况进行诊断和治疗。在就诊前，应注意保持局部清洁，避免搔抓和刺激，避免使用刺激性的清洁剂或护肤品。此外，注意个人卫生，避免不洁性行为，有助于预防和减少相关疾病的发生。