勃起太久小腹疼痛主要原因包括：一是长时间充血；二是肌肉、血管痉挛；三是前列腺等疾病。
一、长时间充血导致的情况。阴茎勃起时间较长会引起下腹部疼痛不适，这是因为长时间的阴茎勃起会致使盆腔内器官，如前列腺，甚至膀胱、直肠等周围都出现显著的充血状态，且充血难以消退。只有当性冲动消失后，充血、水肿逐渐消退，疼痛感才会慢慢消失。此时会出现会阴部或骨盆区、下腹部的胀痛不适。对于持续勃起者，应转移其注意力，缓解其紧张情绪，有时需要让其进行深蹲活动，以期望达到骨盆区血液的分流作用。
二、肌肉、血管痉挛引起的状况。勃起时阴茎及其周围肌肉的血管和下腹部肌肉会因为长时间充血而出现紧张、痉挛，由于长时间的这种紧张和痉挛，就会导致小肚子疼。
三、前列腺疾病相关的情况。阴茎勃起时前列腺也会相应充血，若本身存在前列腺炎等问题，局部充血就很容易引发疼痛。
此外，若勃起时间过长，比如勃起时间超过六小时，就需要紧急向专科医生求助进行治疗。
总之，勃起太久小腹疼痛可能由多种原因引起，要根据具体情况进行分析和处理。如果疼痛持续不缓解或伴有其他异常症状，应及时就医。