密集恐惧症形成的原因目前尚不十分明确，但有一些相关因素被认为可能与之有关。一般认为，大约有一定比例的人可能存在遗传易感性，比如家族中有类似恐惧症表现的人，其亲属患密集恐惧症的概率相对可能更高一些。
遗传因素方面
基因层面影响：研究发现，基因在一定程度上会影响个体对密集物体产生恐惧的易感性。某些特定的基因变异可能使人体更容易对密集排列的物体出现过度的恐惧反应。例如，一些与大脑中情绪调节和感知相关的基因，如果存在特定的突变形式，就可能增加患上密集恐惧症的风险。
心理发育因素
早期经历影响：儿童时期如果有过某些特殊的经历也可能引发密集恐惧症。比如，有的孩子在幼年时看到过一些密集排列的、可能让他们感觉不舒服的图像或场景，并且当时没有得到正确的引导和缓解，就可能在心理上留下阴影，随着成长逐渐发展成密集恐惧症。例如，有的孩子看到密集排列的蚂蚁群，当时产生了强烈的不适感受，后来这种感受可能泛化到其他密集排列的物体上。认知方式作用：个人的认知方式也会对密集恐惧症的形成产生影响。如果一个人本身比较敏感、容易过度解读事物，当看到密集排列的物体时，就可能过度放大这种物体带来的不适感，从而强化恐惧情绪。比如，有人会把密集排列的小孔想象成危险的东西，进而产生强烈的恐惧反应。
大脑神经机制因素
视觉处理异常：从大脑神经机制来看，当人们看到密集排列的物体时，大脑中负责视觉处理和情绪反应的区域可能会出现异常的活动。例如，视觉皮层对密集物体的感知信号传递到情绪相关脑区时，可能会引发过度强烈的恐惧情绪反应。正常情况下，大脑能够平衡对不同视觉刺激的情绪反应，但对于有密集恐惧症的人来说，这种神经信号的传递和处理出现了偏差，导致对密集物体产生超出正常范围的恐惧。情绪调节系统缺陷：大脑中负责情绪调节的系统，如边缘系统等，在密集恐惧症患者身上可能存在功能缺陷。当面对密集物体时，情绪调节系统不能有效地抑制恐惧情绪的产生和蔓延，使得恐惧情绪持续存在并加剧，从而形成密集恐惧症。比如，边缘系统中的杏仁核在正常情况下能适度处理恐惧相关信号，但在密集恐惧症患者中，杏仁核对密集物体相关信号的反应过于强烈，导致恐惧难以控制。