新生儿心肌酶高可能由多种原因造成。一般来说，新生儿心肌酶高常见的原因有以下几类：
一、胎儿期缺氧因素
产前缺氧： 在胎儿时期，如果存在胎盘功能不全、脐带绕颈等情况，会导致胎儿缺氧，进而影响心肌细胞的代谢，使得心肌酶释放增加。比如胎盘早剥的情况下，胎儿获取氧供受到影响，就可能引发心肌酶升高。产时缺氧： 分娩过程中，如果出现难产、产程过长等情况，新生儿可能会发生窒息，导致心肌缺氧受损，从而使心肌酶释放到血液中，引起心肌酶升高。例如急产处理不及时，可能造成新生儿产时缺氧。
二、感染因素
病毒感染： 新生儿感染柯萨奇病毒、巨细胞病毒等病毒时，病毒会侵袭心肌组织，引起心肌炎症反应。以柯萨奇病毒为例，它可直接损伤心肌细胞，导致心肌细胞内的心肌酶释放入血，造成心肌酶升高。一般病毒感染后1 - 2周内可能检测到心肌酶变化。细菌感染： 新生儿如果发生败血症等严重细菌感染，细菌产生的毒素会影响心肌功能，引发心肌损伤，进而使心肌酶升高。比如金黄色葡萄球菌败血症，细菌毒素作用于心肌，导致心肌酶谱异常。
三、先天性心脏病因素
复杂先心病： 一些复杂的先天性心脏病，如法洛四联症等，会使心脏结构和功能异常，导致心肌长期处于负荷过重或缺血状态。以法洛四联症为例，患儿存在右心室流出道梗阻等情况，心肌长期缺氧，心肌细胞受损，心肌酶释放增加。一般出生后不久通过心脏超声等检查可发现先心病情况，同时心肌酶可能异常。简单先心病： 像房间隔缺损等简单先心病，如果病情较重，也会影响心肌功能，引起心肌酶升高。例如较大的房间隔缺损会导致左向右分流增加，加重心脏负担，长期下来心肌受损，心肌酶水平上升。