新生儿心肌酶高可能由多种原因引起。一般来说，新生儿心肌酶升高常见于心肌损伤等情况，比如在新生儿窒息、感染等情况下都可能导致心肌酶升高。
一、缺氧缺血性因素
分娩过程中的缺氧： 新生儿在分娩过程中如果出现窒息等情况，容易导致心肌细胞受损，进而引起心肌酶升高。例如，在胎儿窘迫等情况下，新生儿出生后可能发生缺氧，影响心肌的正常功能，使得心肌酶释放到血液中，导致检测值升高。宫内缺氧： 孕妇在孕期如果存在胎盘功能不全等情况，可能造成胎儿在宫内缺氧，这也会对新生儿的心肌产生影响，引发心肌酶升高。
二、感染因素
病毒感染： 一些病毒感染可累及新生儿心肌，如柯萨奇病毒等。新生儿免疫系统尚未完全发育，容易受到病毒侵袭，病毒感染后会引发心肌的炎症反应，从而导致心肌酶升高。例如，新生儿感染柯萨奇病毒后，病毒在心肌内复制，破坏心肌细胞，使得心肌酶释放增多。细菌感染： 严重的细菌感染，如败血症等，也可能影响新生儿心肌，导致心肌酶升高。细菌产生的毒素等物质会损伤心肌组织，引起心肌酶水平异常。
三、其他因素
早产因素： 早产儿的各个器官发育尚不成熟，包括心肌组织。心肌的发育不完善可能导致心肌酶相对容易出现升高的情况。早产儿的心肌细胞功能相对较弱，在受到一些轻微刺激时，就可能出现心肌酶升高的现象。代谢性因素： 新生儿如果存在低血糖等代谢紊乱情况，也可能影响心肌功能，进而引起心肌酶升高。低血糖会影响心肌的能量供应，导致心肌细胞功能异常，使得心肌酶释放增加。