肠系膜淋巴结炎多由病毒或细菌感染引起，其中病毒感染较为常见，比如常见的柯萨奇B组病毒或其他肠道病毒等，大约有60% - 70%的肠系膜淋巴结炎是由病毒感染导致的；细菌感染相对少一些，像链球菌、葡萄球菌等感染也可能引发。
病毒感染引发的情况
肠道病毒感染为主因： 很多孩子在春秋季节容易感染肠道病毒，从而引发肠系膜淋巴结炎。比如柯萨奇B组病毒，它会通过消化道进入人体，然后侵袭肠系膜淋巴结，导致淋巴结出现肿大、炎症反应。孩子可能会出现腹痛、发热等症状，一般发热体温多在38℃左右。其他病毒也可致病： 像腺病毒等也可能引起肠系膜淋巴结炎。当孩子感染腺病毒后，病毒在体内复制繁殖，累及肠系膜淋巴结，导致淋巴结发炎。
细菌感染相关情况
链球菌感染引发： 链球菌感染人体后，可能会引发全身性的炎症反应，其中就包括肠系膜淋巴结的炎症。例如孩子如果患上链球菌性咽炎，没有及时治疗，细菌可能会蔓延至肠系膜淋巴结，导致淋巴结炎。葡萄球菌感染影响： 葡萄球菌感染也可能波及肠系膜淋巴结。比如皮肤有葡萄球菌感染病灶，细菌可能通过血液循环到达肠系膜淋巴结，引起淋巴结的炎症性改变。
免疫力因素影响
儿童免疫力较弱易发病： 儿童的免疫系统还没有发育完善，相比成年人更容易受到病毒和细菌的侵袭。特别是3 - 7岁的儿童，这个年龄段的孩子免疫系统相对脆弱，当遇到病毒或细菌感染时，更容易引发肠系膜淋巴结炎。比如孩子在幼儿园集体生活中，接触到感染源后，很容易被感染而发病。免疫力低下人群更易反复： 本身免疫力低下的人群，比如患有免疫缺陷病的孩子，或者长期服用免疫抑制剂的孩子，更容易反复发生肠系膜淋巴结炎。因为他们的身体抵御病毒和细菌的能力较弱，一旦有感染源侵入，就更容易引发淋巴结的炎症反应，而且病情可能更容易反复，恢复时间也可能相对较长。