肠系膜淋巴结炎多由病毒、细菌感染引起。比如病毒感染中，像柯萨奇 B 病毒等常见病毒感染是引发肠系膜淋巴结炎的常见原因之一；细菌感染方面，链球菌、葡萄球菌等感染也可能导致该病。
病毒感染因素
肠道病毒感染： 肠道病毒很容易侵袭人体，其中柯萨奇 B 病毒较为常见。儿童免疫系统发育尚不完善，更容易受到肠道病毒的侵袭，当肠道病毒感染后，可能会累及肠系膜淋巴结，引发炎症反应。一般在病毒流行季节，如夏季、秋季等，儿童患肠系膜淋巴结炎的风险相对较高。上呼吸道病毒感染蔓延： 上呼吸道感染时，病毒可通过血液循环到达肠系膜淋巴结。比如孩子患上普通感冒，由病毒引起的感冒，病毒会随着血液流到肠系膜淋巴结所在部位，从而导致淋巴结发炎。
细菌感染因素
链球菌感染： 链球菌感染是引发肠系膜淋巴结炎的细菌因素之一。当人体抵抗力下降时，链球菌容易侵入机体。例如孩子皮肤有破损，链球菌可能通过破损处进入体内，或者通过呼吸道侵入，进而累及肠系膜淋巴结，导致淋巴结出现炎症反应。葡萄球菌感染： 葡萄球菌感染也可能引发肠系膜淋巴结炎。葡萄球菌可以通过多种途径进入人体，比如经口进入消化道，然后随着血液循环到达肠系膜淋巴结部位，引起淋巴结的炎症变化。而且在一些卫生条件较差的环境中，孩子感染葡萄球菌的风险会增加。
其他因素
免疫力低下： 儿童自身免疫力相对较低，相比成年人更容易受到病原体的侵袭。当孩子营养不良、过度疲劳等情况出现时，免疫力会进一步下降，这就使得病毒和细菌更容易侵犯肠系膜淋巴结，引发炎症。比如长期挑食的孩子，营养摄入不均衡，免疫力可能受到影响，从而增加患肠系膜淋巴结炎的几率。肠道寄生虫感染： 肠道内如果有寄生虫感染，也可能间接导致肠系膜淋巴结炎。例如蛔虫感染，蛔虫在肠道内活动时，可能会刺激肠系膜淋巴结，引发炎症反应。不过随着生活条件改善和卫生习惯的养成，因肠道寄生虫感染导致肠系膜淋巴结炎的情况相对减少，但在一些卫生条件较差的地区仍有发生。