一般孩子睡觉磨牙的原因较多，其中最常见的是口腔因素，比如孩子口腔里有龋齿、牙齿排列不整齐等，据统计，约有20% - 30%的孩子磨牙与口腔局部因素相关。
口腔局部因素：
牙齿问题： 如果孩子有龋齿，牙齿会有疼痛、不适等情况，在睡觉的时候可能会通过磨牙来试图缓解；还有如果孩子牙齿排列不整齐，上下牙齿咬合关系不好，也容易出现磨牙现象，比如个别牙齿错位、牙列拥挤等。口腔炎症： 像牙龈炎、牙周炎等口腔炎症，会让孩子口腔内感觉不舒服，进而可能导致睡觉磨牙。
神经系统因素：
神经兴奋： 孩子白天过于兴奋或者紧张，比如玩耍过度、看了惊险刺激的动画片等，会使得大脑皮质兴奋度增高，入睡后大脑皮质仍有部分区域处于兴奋状态，就可能引起咀嚼肌收缩，出现磨牙。一般这种情况在孩子年龄较小、神经系统发育还不完善时更易发生。睡眠障碍： 有睡眠障碍的孩子，比如患有睡眠呼吸暂停综合征等，也可能伴随磨牙症状，这是因为睡眠过程中呼吸等方面的异常影响了神经调节，导致磨牙。
营养因素：
缺乏微量元素： 当孩子体内缺乏钙、磷等微量元素时，会影响神经系统的调节功能，使得咀嚼肌兴奋，从而出现磨牙。例如，有研究发现，约10%左右磨牙的孩子存在钙缺乏的情况。维生素D缺乏： 维生素D缺乏会影响钙的吸收，如果孩子维生素D不足，也可能导致神经肌肉兴奋性增高，引发磨牙。
其他因素：
肠道寄生虫： 虽然现在卫生条件好了，但如果孩子肠道有蛔虫等寄生虫，寄生虫产生的毒素及其代谢产物会刺激肠道，引起肠道蠕动增加，同时也会影响神经系统，导致孩子睡觉磨牙。不过这种情况在城市儿童中相对较少见，但在卫生条件较差的地区仍有发生。疾病影响： 一些全身性疾病，比如消化不良、胃肠功能紊乱等，也可能引起孩子睡觉磨牙。孩子消化不良时，胃肠蠕动异常，会通过神经反射影响咀嚼肌，导致磨牙。