紧急避孕药可能会带来一些副作用。一般来说，服用紧急避孕药后，约有10%的人可能会出现月经紊乱，比如服药后一周左右可能出现撤退性出血，出血量通常比正常月经量少。
胃肠道方面的副作用
恶心： 部分人服用紧急避孕药后会出现恶心症状，一般持续时间较短，可能几个小时就会缓解，但也有少数人恶心症状会比较明显，持续时间稍长。呕吐： 如果在服药后短时间内发生呕吐，可能会影响药物的吸收效果，这时候可能需要补服药物，但具体情况要遵医嘱。
内分泌系统的影响
月经周期改变： 紧急避孕药会干扰内分泌，导致月经周期紊乱。有的女性服药后月经会提前，有的则会推迟。提前或推迟的时间可能在1 - 2周左右。激素水平波动： 它会使体内的雌激素、孕激素水平出现波动，长期频繁使用可能会对内分泌系统造成较大影响，增加内分泌失调的风险。
其他可能出现的副作用
头晕乏力： 少数人服用紧急避孕药后会有头晕、乏力的感觉，一般休息后可逐渐缓解，但在头晕乏力期间可能会影响正常的生活和工作，比如开车、操作机械等需要高度集中注意力的活动就需要避免。乳房胀痛： 部分女性服药后可能会出现乳房胀痛的情况，胀痛程度因人而异，有的较为轻微，有的可能会比较明显，一般会在一段时间后自行缓解。