口腔溃疡反复的原因较多，比如约20% - 30%的复发性阿弗他溃疡与遗传因素有关，若家族中有多人反复长口腔溃疡，那么自身患病几率会相对较高。
一、免疫因素相关
自身免疫反应异常： 当人体免疫系统出现紊乱时，可能会错误地攻击口腔黏膜组织，从而导致口腔溃疡反复发生。例如，在一些自身免疫性疾病患者中，口腔溃疡是常见的伴随症状之一。免疫功能低下： 当机体的免疫功能处于较低水平时，如长期劳累、睡眠严重不足等情况，身体抵御病原体及修复组织的能力下降，就容易让口腔溃疡反复出现。比如连续熬夜1周以上，就可能使口腔溃疡复发风险增加。
二、营养缺乏方面
维生素缺乏： 尤其是维生素B族（如B2、B6、B12等）以及维生素C缺乏时，会影响口腔黏膜的正常代谢，导致黏膜抵抗力下降，引发口腔溃疡反复。一般来说，日常饮食中蔬菜、水果摄入不足的人群更容易出现这类维生素缺乏情况，比如连续1个月每天蔬菜摄入少于200克、水果少于100克。微量元素缺乏： 像锌、铁等微量元素缺乏也与口腔溃疡反复有关。锌参与人体多种酶的合成和代谢，缺铁会影响血红蛋白的合成及氧的运输，进而影响口腔黏膜的健康，导致口腔溃疡反复出现。
三、生活方式因素
作息不规律： 长期熬夜、睡眠质量差会打乱人体的生物钟，影响身体的正常代谢和修复过程，使得口腔黏膜容易受损，从而引发口腔溃疡反复。例如，长期每天睡眠不足6小时的人，口腔溃疡复发频率比睡眠充足的人高出约50%。精神压力过大： 当人长期处于高压力状态下，会通过神经内分泌系统影响身体的免疫功能和代谢等，导致口腔溃疡反复。比如工作压力大的上班族，若连续2 - 3个月处于高强度工作状态，口腔溃疡复发的概率明显上升。饮食不当： 经常吃辛辣、刺激性食物，如辣椒、花椒等，或者过烫的食物，会对口腔黏膜造成直接的刺激和损伤，容易引发口腔溃疡反复。另外，过度饮酒也会破坏口腔黏膜的屏障功能，增加口腔溃疡复发的可能性。