HPV病毒主要通过性传播感染，约70%~80%的人在一生中都会感染HPV，其中大部分是通过无保护措施的性行为感染的。
通过性行为传播
性伴侣过多：与多个性伴侣发生性行为会大大增加感染HPV的风险。因为多个性伴侣意味着接触不同的HPV毒株的机会增多。例如，有研究表明，性伴侣超过10个的人，感染高危型HPV的几率会明显升高。无保护措施的性行为：不使用安全套等防护措施时，HPV病毒更容易在性接触中传播。安全套能在一定程度上阻挡病毒的传播，但不是绝对的，即使使用安全套也不能完全排除感染风险，但能大大降低感染几率。
密切接触传播
间接接触感染：接触被HPV污染的物品也可能感染，比如接触了带有HPV病毒的毛巾、马桶座圈等。不过这种情况相对较少见，因为HPV离开人体后存活时间较短，但在温暖、潮湿的环境中可能存活数小时至数天。比如在公共浴室、宾馆等场所，如果接触了被污染的物品，就有感染风险，但相比性传播，概率要低很多。母婴传播：孕妇如果感染了HPV，在分娩过程中，胎儿通过产道时可能会感染HPV，引发喉部乳头瘤病等疾病。不过这种母婴传播的情况相对少见，目前有相关措施可以降低母婴传播的风险，比如医生会根据孕妇的具体情况采取相应的处理手段。
免疫功能低下感染
患有免疫性疾病的人群：像艾滋病患者，由于自身免疫系统被严重破坏，对HPV的抵抗力大幅下降，更容易感染HPV，而且感染后也更难清除病毒，发展为相关病变的几率也更高。长期使用免疫抑制剂的人：比如器官移植后需要长期服用免疫抑制剂来防止排异反应的患者，他们的免疫功能受到抑制，感染HPV的可能性增加，并且感染后病情可能更严重，恢复也更困难。