灰趾甲可以通过药物治疗、手术治疗等方法改善，一般外用抗真菌药物治疗周期可能较长，如外用阿莫罗芬搽剂，每周使用1-2次，连续使用数月。
外用药物治疗
阿莫罗芬搽剂： 属于局部抗真菌药，能抑制真菌细胞膜合成，从而发挥抗真菌作用。使用时要先清洁病甲，然后涂抹，一般每周使用1-2次，需要连续使用数月才能看到较好效果。环吡酮胺乳膏： 同样是外用抗真菌药物，通过改变真菌细胞膜的完整性，影响其代谢过程来发挥抑菌或杀菌作用。涂抹在病甲部位，每天使用1-2次，坚持使用对轻度灰趾甲有一定疗效。
口服药物治疗
伊曲康唑胶囊： 是一种合成的三氮唑类抗真菌药，作用机制是高度选择性干扰真菌的细胞色素P450的活性，从而抑制真菌细胞膜上麦角固醇的合成。采用冲击疗法，即服用一周，停药三周为一个疗程，一般需要2-3个疗程，但服用前需检查肝功能，因为它可能对肝脏有一定影响。特比萘芬片： 能特异性地抑制真菌角鲨烯环氧化酶，阻碍真菌细胞膜角鲨烯环氧化反应，影响真菌固醇的早期生物合成，从而发挥杀菌作用。一般每天服用一次，连续服用数周，同样服药前要关注肝功能情况。
手术治疗
拔甲术： 适用于单发的灰趾甲。医生会将病甲拔除，不过术后恢复需要一定时间，而且拔甲后还需要配合抗真菌药物治疗，否则新长出来的指甲仍可能再次被感染，术后要注意伤口避免感染。激光治疗： 利用激光的能量破坏真菌细胞。治疗过程相对较舒适，一般需要多次治疗，每次治疗间隔一定时间，激光治疗对一些顽固的灰趾甲有一定效果，但费用相对较高。